Celní správu České republiky tvoří Generální ředitelství cel s pozicí správního úřadu s celostátní působností, dále osm celních ředitelství a jim podřízených 54 celních úřadů s vymezenou územní působností. Celnímu ředitelství Praha je podřízeno 11 celních úřadů s územní působností Praha a Středočeský kraj.

Celní ředitelství Praha bylo zřízeno podle zákona č. 185/2004 Sb., o Celní správě České republiky (dále jen „zákon o celní správě“) jako správní úřad pro oblast celnictví. Svěřené kompetence celního ředitelství jsou vymezeny ustanovením § 4 zákona o celní správě.

V oblasti celnictví a v rámci své vymezené působnosti celní ředitelství:

 - řídí celní úřady ve svém územním obvodu, s výjimkou případů, kdy je řídí Generální ředitelství cel,
 - rozhoduje o povolení být ručitelem pro globální zajištění celního dluhu, o udělení povolení nezajišťovat celní dluh v režimu tranzitu, vydává (na základě žádosti) závazné informace o původu zboží,
 - rozhoduje (na základě žádosti) o povolení osvědčovat na faktuře nebo jiném obchodním dokladu původ zboží,
 - spravuje cla v rozsahu a způsobem stanoveným právním předpisem upravujícím správu daní a poplatků, pokud zvláštní právní předpisy nestanoví jinak,
 - spravuje daně v rozsahu a způsobem stanoveným právním předpisem upravujícím správu daní,
 - provádí pátrání v oblasti podloudné přepravy a nelegálního obchodu se zbraněmi, střelivem, výbušninami, vojenským materiálem a radioaktivními látkami,
 - v postavení policejního orgánu provádí úkony v řízení o vybraných trestných činech (spáchaných porušením celních předpisů a předpisů o dovozu, vývozu nebo průvozu zboží, a dále porušením právních předpisů při umístění a pořízení zboží v členských státech Evropských společenství, je-li toto zboží dopravováno přes státní hranice ČR, a v případech porušení předpisů daňových, jsou-li celní orgány správcem daně),
 - zajišťuje výkon mobilních kontrolních činností prostřednictvím mobilních skupin.

Celní ředitelství Praha dále vykonává ve vymezeném rozsahu odbornou agendu související s vydáváním závazných informací o sazebním zařazení zboží.

Územní obvod je tvořen územními obvody těchto celních úřadů:
Benešov, Kladno, Kolín, Mělník, Mladá Boleslav, Praha 1, Praha 2, Praha D1, Praha D5, Praha D8, Praha Ruzyně.