Procesním předpisem pro správu spotřebních daní je zákon č. 280/2009 Sb., daňový řád. Uvedený právní předpis tedy upravuje základní procesní instituty, podle kterých postupují správci daně při své činnosti a rovněž jsou zde stanoveny pravidla pro daňové subjekty.  Správci daně v řízení o daních jednají v souladu se zákony a jinými obecně závaznými právními předpisy, chrání zájmy státu a dbají přitom na zachování práv a právem chráněných zájmů daňových subjektů a ostatních osob zúčastněných na daňovém řízení. Cílem daňového řízení je stanovení a vybrání daně tak, aby nebyly zkráceny daňové příjmy. Daňové řízení je provázeno základními zásadami stanovenými v citovaném zákoně.

Zákon č. 353/2003 Sb., o spotřebních daních, ve znění pozdějších předpisů, rovněž vymezuje správní delikty fyzických a právnických osob, které se týkají porušení povinností v oblasti spotřebních daní. V řízení o správních deliktech podle části šesté ovšem postupují celní orgány podle zákona č. 200/1990 Sb., o přestupcích, ve znění pozdějších předpisů, a zákona č. 500/2004 Sb., správní řád, ve znění pozdějších předpisů.

V souvislosti se správou spotřebních daní má celní správa postavení správního orgánu v řízení při povinnosti značit líh ve spotřebitelském balení vyrobený na daňovém území České republiky nebo na toto území dovezený. Při řízení podle zákona č. 676/2004 Sb., o povinném značení lihu, ve znění pozdějších předpisů, se postupuje podle správního řádu.