Celní správa spravuje spotřební daně, které patří k nejvýznamnějším příjmům do státního rozpočtu. Spotřební daň se vybírá z piva, vína, tabákových výrobků, lihu, minerálních olejů (produkty z ropy – např. pohonné hmoty) a ze zdrojů energie zatěžující životní prostředí.
V roce 2012 vybrala celní správa od výrobců a dovozců na území Plzeňského a Karlovarského kraje ze zboží podléhajícího spotřební dani 6 miliard Kč. Výběr spotřební daně je přibližně stejný jako za rok 2011.
Nejvíce se tradičně na západě Čech vybralo z lihovin a piva, jelikož zde sídlí nejvýznamnější výrobci těchto komodit zboží. Z lihovin činila spotřební daň 2,5 miliardy a z piva přes 2 miliardy Kč. Z vína např. činila vybraná daň 41 miliónů, což je o 10 miliónů více než loni.
Na cle ze zboží dovezeného ze států mimo EU vybrali západočeští celníci (bývalé CŘ Plzeň) 515 miliónů Kč.
Celkově vybrala Celní správa ČR v roce 2012 na spotřebních daních a cle přes 146 miliard Kč.
