Celní správa je správcem spotřebních daní, které tvoří značný příjem do státního rozpočtu. Celníci vybírají spotřební daně (z piva, vína, tabákových výrobků, lihu, minerálních olejů a od roku 2008 také ze zdrojů energie zatěžujících životní prostředí) jak z dováženého zboží, tak ze zboží vyrobeného v tuzemsku.
Celní ředitelství Plzeň vybralo od dovozců a výrobců v Plzeňském a Karlovarském kraji za rok 2010 na spotřebních daních 4 miliardy 677 milionů korun.
V západočeském regionu se nejvíce vybralo na spotřební dani z lihu a piva. Celní ředitelství Plzeň zaznamenává standardně u těchto vybraných výrobků nejvyšší výběr spotřební daně v porovnání s ostatními regiony, neboť v Plzeňském a Karlovarském kraji sídlí nejvýznamnější tuzemští výrobci lihovin a piva. Z lihu a lihovin vybraná spotřební daň činí 2 miliardy 384 milionů korun a z piva 1 miliardu 975 milionů korun.
Se správou spotřební daně také souvisí kontrolní činnost a vyhledávání nelegálního zboží. Patří sem kontroly zaměřené na přepravu a prodej zboží nebo odhalování skladů a nelegálních výroben zboží podléhajícího spotřební dani. Západočeští celníci například zajistili v roce 2010 přes 2,5 milionu kusů nezdaněných cigaret a doutníků a 1.730 kg tabáku. Minimální spotřební daň z jedné cigarety je přitom 2,01 Kč a daň z 1 kg tabáku 1.340 Kč. Zajištěním nelegálních tabákových výrobků se tak zabránilo daňovému úniku ve výši téměř 8 milionů korun.
